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主要職責是：

（一）貫徹落實港航口岸和漁業(yè)工作發(fā)展戰(zhàn)略，統(tǒng)籌研究和組織實施港航口岸和漁業(yè)工作的發(fā)展規(guī)劃、重大政策；組織起草港航口岸和漁業(yè)規(guī)范性文件草案。

（二）擬訂港航口岸和漁業(yè)專項規(guī)劃、政策和標準并組織實施。依法開展港航口岸和漁業(yè)行政許可及其監(jiān)督管理。依法開展港航、漁業(yè)綜合行政執(zhí)法工作。負責港航、漁業(yè)信用體系建設(shè)。

（三）負責港航口岸和漁業(yè)投資管理。負責港航口岸和漁業(yè)項目資金安排和監(jiān)督管理。提出港航口岸和漁業(yè)固定資產(chǎn)投資規(guī)模、方向和資金安排建議并監(jiān)督實施。

（四）負責高效生態(tài)漁業(yè)產(chǎn)業(yè)體系建設(shè)。組織構(gòu)建現(xiàn)代漁業(yè)產(chǎn)業(yè)體系、生產(chǎn)體系、經(jīng)營體系。指導設(shè)施漁業(yè)、生態(tài)漁業(yè)發(fā)展。落實漁業(yè)水域生態(tài)環(huán)境保護要求，配合做好漁業(yè)生態(tài)環(huán)境污染的調(diào)查處理工作。指導特色漁業(yè)、水產(chǎn)品加工、休閑漁業(yè)發(fā)展工作。培育、保護漁業(yè)品牌。指導漁民合作經(jīng)濟組織、漁業(yè)社會化服務(wù)體系、新型漁業(yè)經(jīng)營主體建設(shè)與發(fā)展。指導水產(chǎn)品營銷管理和展示展銷活動。承辦有關(guān)漁業(yè)涉外事務(wù)，組織開展?jié)O業(yè)貿(mào)易促進和有關(guān)國際交流合作，指導遠洋漁業(yè)發(fā)展工作。承擔漁業(yè)統(tǒng)計和漁業(yè)信息化有關(guān)工作。

（五）負責漁業(yè)產(chǎn)業(yè)的監(jiān)督管理。監(jiān)督落實雙多邊漁業(yè)條約和協(xié)定。負責漁場修復振興、遠洋漁業(yè)管理和漁政漁港監(jiān)督管理。負責漁業(yè)安全生產(chǎn)監(jiān)督管理。指導漁業(yè)行業(yè)安全生產(chǎn)工作，指導休閑漁船安全管理工作。負責初級水產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)督管理。指導初級水產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)管體系建設(shè)。組織開展初級水產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)測、追溯。負責漁業(yè)投入品的監(jiān)督管理。

（六）負責漁業(yè)資源管理。指導漁業(yè)水域以及漁業(yè)資源的保護與管理，負責水生野生動植物保護工作。指導水產(chǎn)品產(chǎn)地環(huán)境管理。牽頭管理水生外來物種。

（七）負責漁業(yè)防災減災、水產(chǎn)養(yǎng)殖重大病害監(jiān)測防治工作。指導水生動植物防疫檢疫體系建設(shè)，組織、監(jiān)督轄區(qū)內(nèi)水生動植物防疫檢疫工作。負責海洋觀測預報，做好海洋預警監(jiān)測和防災減災工作，參與重大海洋災害應(yīng)急處置，配合海上搜救工作。

（八）推動漁業(yè)科技體制改革和漁業(yè)技術(shù)推廣隊伍體系建設(shè)。指導漁業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和漁技推廣體系建設(shè)，組織開展?jié)O業(yè)領(lǐng)域應(yīng)用技術(shù)研究、科技成果轉(zhuǎn)化和技術(shù)推廣。指導漁業(yè)職業(yè)技能開發(fā)，組織新型職業(yè)漁民培育、漁業(yè)科技人才培養(yǎng)和漁村實用人才培訓工作。

（九）負責口岸管理工作。負責擬訂口岸開放計劃并組織實施，協(xié)調(diào)口岸查驗單位設(shè)置。負責口岸基礎(chǔ)設(shè)施、功能建設(shè)和開放（臨時開放）、對外啟用項目的管理工作。協(xié)調(diào)推進口岸管理服務(wù)建設(shè)，優(yōu)化口岸通關(guān)服務(wù)。

（十）負責水路運輸和港口監(jiān)督管理。負責全市航道、水路建設(shè)市場、水路運輸市場監(jiān)督管理。負責港口岸線使用和港口項目投資管理。指導港口物流發(fā)展，負責港口工程的質(zhì)量監(jiān)督管理。指導港口引航管理。

（十一）指導港航行業(yè)安全生產(chǎn)和應(yīng)急管理工作。依法承擔各類船舶、海上設(shè)施和船用產(chǎn)品的檢驗監(jiān)督管理工作。

（十二）指導水路、港口行業(yè)生態(tài)保護及修復、節(jié)能減排、污染防治等工作。

（十三）配合做好全市水路交通、漁業(yè)領(lǐng)域相關(guān)工作。

（十四）完成市委、市政府交辦的其他任務(wù)。

（十五）與市市場監(jiān)督管理局的有關(guān)職責分工。市港航口岸和漁業(yè)管理局負責初級水產(chǎn)品在進入批發(fā)、零售市場或者生產(chǎn)加工企業(yè)前的質(zhì)量安全監(jiān)督管理。初級水產(chǎn)品進入批發(fā)、零售市場或者生產(chǎn)加工企業(yè)后，其質(zhì)量安全由市市場監(jiān)督管理局監(jiān)督管理。市港航口岸和漁業(yè)管理局與市市場監(jiān)督管理局要建立食品安全產(chǎn)地準出、市場準入和追溯機制，加強協(xié)調(diào)配合和工作銜接，形成監(jiān)管合力。